Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf1Q6ZPE2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sbf1Q6ZPE2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sbf1Q6ZPE2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbf1Q6ZPE2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms