Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic3Q6X1Y6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Asic3Q6X1Y6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Asic3Q6X1Y6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms