Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shc4Q6S5L9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shc4Q6S5L9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shc4Q6S5L9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shc4Q6S5L9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shc4Q6S5L9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shc4Q6S5L9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Shc4Q6S5L9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Shc4Q6S5L9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shc4Q6S5L9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shc4Q6S5L9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shc4Q6S5L9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shc4Q6S5L9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shc4Q6S5L9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shc4Q6S5L9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms