Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms