Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d2Q6PHS9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d2Q6PHS9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms