Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85bQ6PDY0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms