Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb39Q6PDK0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb39Q6PDK0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb39Q6PDK0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb39Q6PDK0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb39Q6PDK0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbtb39Q6PDK0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zbtb39Q6PDK0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbtb39Q6PDK0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zbtb39Q6PDK0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb39Q6PDK0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms