Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BC061212Q6P8K3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms