Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt39Q6IFX4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt39Q6IFX4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms