Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt42Q6IFX2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt42Q6IFX2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms