Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pdzrn3Q69ZS0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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