Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PnkdQ69ZP3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PnkdQ69ZP3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms