Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

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Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn4Q69Z26 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn4Q69Z26 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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