Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nptx1Q62443 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nptx1Q62443 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nptx1Q62443 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nptx1Q62443 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nptx1Q62443 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nptx1Q62443 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nptx1Q62443 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nptx1Q62443 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nptx1Q62443 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nptx1Q62443 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms