Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Prm3Q62100 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prm3Q62100 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Prm3Q62100 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms