Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4933416C03RikQ3V063 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933416C03RikQ3V063 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
4933416C03RikQ3V063 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4933416C03RikQ3V063 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4933416C03RikQ3V063 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4933416C03RikQ3V063 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4933416C03RikQ3V063 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933416C03RikQ3V063 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4933416C03RikQ3V063 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms