Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29609Q3UU56 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29609Q3UU56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms