Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Greb1Q3UHK3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Greb1Q3UHK3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms