Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Eif3j1Q3UGC7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3j1Q3UGC7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms