Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtpbp6Q3U6U5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
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