Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Calr4Q3TQS0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Calr4Q3TQS0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms