Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm3Q32NY4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnnm3Q32NY4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnnm3Q32NY4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnnm3Q32NY4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnnm3Q32NY4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnnm3Q32NY4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm3Q32NY4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm3Q32NY4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm3Q32NY4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm3Q32NY4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms