Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 CYP27A1-203ENST00000445971 903 ntTSL 519.6■□□□□ 0.733e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 218.96■□□□□ 0.633e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 FILIP1L-207ENST00000476723 567 ntTSL 418.73■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.023e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.093e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.13e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 FILIP1L-210ENST00000495625 2898 ntTSL 1 (best)13.73□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 GSDMB-212ENST00000520542 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 GSDMB-205ENST00000418519 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.77□□□□□ -0.533e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 GSDMB-208ENST00000477054 4655 ntTSL 511.56□□□□□ -0.563e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 TFPI-211ENST00000481132 7690 ntTSL 28.13□□□□□ -1.113e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.263e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.263e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.33e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 46.56□□□□□ -1.363e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.433e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.623e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.673e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 TFPI-212ENST00000481389 599 ntTSL 54.14□□□□□ -1.753e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 TFPI-208ENST00000435414 687 ntTSL 53.98□□□□□ -1.773e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.833e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 52.28□□□□□ -2.043e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 AC079801.1-201ENST00000623753 388 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.94e-6■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.165e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.25□□□□□ -1.255e-8■□□□□ 8.2
SAFBQ15424 XRCC2-202ENST00000495707 4728 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.617e-17■□□□□ 8.1
SAFBQ15424 XRCC2-201ENST00000359321 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.637e-17■□□□□ 8.1
SAFBQ15424 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 8.1
SAFBQ15424 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.833e-6■□□□□ 8.1
SAFBQ15424 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)3.03□□□□□ -1.923e-6■□□□□ 8.1
SAFBQ15424 JMJD1C-201ENST00000327520 3781 ntTSL 22.34□□□□□ -2.033e-6■□□□□ 8.1
SAFBQ15424 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.173e-6■□□□□ 8.1
SAFBQ15424 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.673e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.073e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.663e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 DIP2A-207ENST00000473752 1638 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.463e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)17.7■□□□□ 0.423e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 DIP2A-212ENST00000494435 2063 ntTSL 216.09■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 ANKLE2-205ENST00000538591 886 ntTSL 39.29□□□□□ -0.923e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 ANKLE2-211ENST00000545623 1288 ntTSL 39.14□□□□□ -0.953e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 ANKLE2-204ENST00000535036 741 ntTSL 57.89□□□□□ -1.153e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.015e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.455e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.45e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.355e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.35e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.295e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 EHBP1-220ENST00000496857 1262 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.45e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 AFDN-221ENST00000511637 5999 ntTSL 1 (best)12.08□□□□□ -0.475e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)11.54□□□□□ -0.565e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 AFDN-217ENST00000507679 670 ntTSL 38.95□□□□□ -0.985e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 PLCB1-217ENST00000628900 560 ntTSL 48.44□□□□□ -1.065e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 PLCB1-215ENST00000626966 2996 ntTSL 28.24□□□□□ -1.095e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.355e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.435e-6■□□□□ 8
SAFBQ15424 PLCB1-207ENST00000475958 443 ntTSL 35.79□□□□□ -1.485e-6■□□□□ 8
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