Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32,26■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32,22■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32,2■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Vps8Q0P5W1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32,16■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Vps8Q0P5W1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32,1■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,08■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,73
Vps8Q0P5W1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32,03■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32,01■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32,01■■■□□ 2,72
Vps8Q0P5W1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Vps8Q0P5W1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Vps8Q0P5W1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,4 ms