Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm3Q08189 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tgm3Q08189 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms