Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Col17a1Q07563 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Col17a1Q07563 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Col17a1Q07563 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Col17a1Q07563 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.9 ms