Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmbpQ07456 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms