Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hspg2Q05793 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hspg2Q05793 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms