Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gjb5Q02739 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjb5Q02739 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb5Q02739 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms