Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp9xP70398 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9xP70398 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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