Protein–RNA interactions for Protein: P61027

Rab10, Ras-related protein Rab-10, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab10P61027 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab10P61027 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab10P61027 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab10P61027 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab10P61027 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab10P61027 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab10P61027 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab10P61027 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab10P61027 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab10P61027 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab10P61027 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab10P61027 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab10P61027 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab10P61027 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab10P61027 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab10P61027 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab10P61027 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab10P61027 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab10P61027 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab10P61027 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab10P61027 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab10P61027 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab10P61027 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab10P61027 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab10P61027 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab10P61027 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab10P61027 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab10P61027 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab10P61027 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab10P61027 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab10P61027 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab10P61027 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab10P61027 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab10P61027 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab10P61027 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms