Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GferP56213 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GferP56213 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GferP56213 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GferP56213 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GferP56213 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GferP56213 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GferP56213 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GferP56213 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GferP56213 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GferP56213 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GferP56213 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GferP56213 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GferP56213 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GferP56213 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GferP56213 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GferP56213 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GferP56213 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GferP56213 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GferP56213 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GferP56213 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GferP56213 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GferP56213 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GferP56213 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GferP56213 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GferP56213 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GferP56213 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GferP56213 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GferP56213 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GferP56213 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GferP56213 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GferP56213 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GferP56213 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GferP56213 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GferP56213 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GferP56213 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GferP56213 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GferP56213 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GferP56213 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GferP56213 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GferP56213 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GferP56213 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GferP56213 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GferP56213 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GferP56213 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GferP56213 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GferP56213 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GferP56213 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GferP56213 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GferP56213 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GferP56213 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GferP56213 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GferP56213 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GferP56213 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GferP56213 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GferP56213 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GferP56213 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GferP56213 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GferP56213 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GferP56213 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GferP56213 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GferP56213 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GferP56213 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GferP56213 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GferP56213 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GferP56213 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GferP56213 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GferP56213 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GferP56213 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GferP56213 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GferP56213 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GferP56213 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GferP56213 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GferP56213 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GferP56213 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms