Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpn5P54830 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn5P54830 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.7 ms