Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efnb1P52795 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms