Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2e1P52482 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2e1P52482 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e1P52482 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms