Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa10P50708 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa10P50708 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa10P50708 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa10P50708 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa10P50708 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa10P50708 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa10P50708 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa10P50708 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa10P50708 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa10P50708 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms