Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TspoP50637 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TspoP50637 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TspoP50637 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TspoP50637 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TspoP50637 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TspoP50637 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TspoP50637 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TspoP50637 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TspoP50637 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TspoP50637 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TspoP50637 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TspoP50637 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TspoP50637 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TspoP50637 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TspoP50637 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TspoP50637 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TspoP50637 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TspoP50637 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TspoP50637 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TspoP50637 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TspoP50637 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TspoP50637 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TspoP50637 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TspoP50637 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TspoP50637 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TspoP50637 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TspoP50637 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TspoP50637 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TspoP50637 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TspoP50637 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TspoP50637 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TspoP50637 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TspoP50637 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TspoP50637 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TspoP50637 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TspoP50637 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TspoP50637 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TspoP50637 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TspoP50637 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TspoP50637 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TspoP50637 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TspoP50637 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TspoP50637 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TspoP50637 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TspoP50637 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TspoP50637 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TspoP50637 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TspoP50637 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TspoP50637 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TspoP50637 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TspoP50637 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TspoP50637 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TspoP50637 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TspoP50637 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TspoP50637 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TspoP50637 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TspoP50637 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TspoP50637 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TspoP50637 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TspoP50637 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TspoP50637 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TspoP50637 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TspoP50637 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TspoP50637 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TspoP50637 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TspoP50637 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TspoP50637 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TspoP50637 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TspoP50637 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TspoP50637 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TspoP50637 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TspoP50637 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TspoP50637 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TspoP50637 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TspoP50637 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms