Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hcls1P49710 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcls1P49710 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcls1P49710 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hcls1P49710 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcls1P49710 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcls1P49710 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcls1P49710 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcls1P49710 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcls1P49710 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcls1P49710 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hcls1P49710 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcls1P49710 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcls1P49710 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcls1P49710 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcls1P49710 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcls1P49710 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcls1P49710 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcls1P49710 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcls1P49710 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hcls1P49710 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hcls1P49710 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hcls1P49710 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hcls1P49710 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hcls1P49710 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms