Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnni3P48787 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnni3P48787 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138 ms