Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sipa1P46062 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sipa1P46062 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sipa1P46062 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms