Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp9P41245 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp9P41245 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp9P41245 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms