Protein–RNA interactions for Protein: P40463

VHS2, Protein VHS2, yeastyeast

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS2P40463 GEF1YJR040W 2340 nt5.02□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YJR124CYJR124C 1347 nt5.02□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YDL177CYDL177C 513 nt5.02□□□□□ -1.61
VHS2P40463 RRP1YDR087C 837 nt5.02□□□□□ -1.61
VHS2P40463 UBC6YER100W 753 nt5.02□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YGR176WYGR176W 348 nt5.02□□□□□ -1.61
VHS2P40463 PRI1YIR008C 1230 nt5.02□□□□□ -1.61
VHS2P40463 URA1YKL216W 945 nt5.02□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YOL046CYOL046C 675 nt5.02□□□□□ -1.61
VHS2P40463 NUP49YGL172W 1419 nt5.02□□□□□ -1.61
VHS2P40463 ICP55YER078C 1536 nt5.02□□□□□ -1.61
VHS2P40463 GIP2YER054C 1647 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 GUD1YDL238C 1470 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 DBF2YGR092W 1719 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 GAS3YMR215W 1575 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 AGX1YFL030W 1158 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 DYS1YHR068W 1164 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 SPO12YHR152W 522 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YJL144WYJL144W 315 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 GCN3YKR026C 918 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 COX5AYNL052W 462 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 MRPL10YNL284C 969 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 SPE3YPR069C 882 nt5.01□□□□□ -1.61
VHS2P40463 SAL1YNL083W 1485 nt5□□□□□ -1.61
VHS2P40463 NOG2YNR053C 1461 nt5□□□□□ -1.61
VHS2P40463 MUM3YOR298W 1440 nt5□□□□□ -1.61
VHS2P40463 SUF5tG(CCC)O 72 nt5□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YDR541CYDR541C 1035 nt5□□□□□ -1.61
VHS2P40463 AAD6YFL056C 639 nt5□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YKR032WYKR032W 315 nt5□□□□□ -1.61
VHS2P40463 PPT1YGR123C 1542 nt5□□□□□ -1.61
VHS2P40463 COX15YER141W 1461 nt5□□□□□ -1.61
VHS2P40463 MSC3YLR219W 2187 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS2P40463 PPH21YDL134C 1110 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS2P40463 PEX13YLR191W 1161 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS2P40463 AAD14YNL331C 1131 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS2P40463 TMA46YOR091W 1038 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS2P40463 ENV9YOR246C 993 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS2P40463 ARB1YER036C 1833 nt4.99□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YIL055CYIL055C 1884 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 EFT2YDR385W 2529 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 EFT1YOR133W 2529 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 RGD1YBR260C 2001 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 HED1YDR014W-A 489 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 SWD1YAR003W 1281 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 SRN2YLR119W 642 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 TSR3YOR006C 942 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 CKA2YOR061W 1020 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YPL014WYPL014W 1146 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 SEC62YPL094C 825 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 SDA1YGR245C 2304 nt4.98□□□□□ -1.61
VHS2P40463 ORC5YNL261W 1440 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YME1YPR024W 2244 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YML133CYML133C 4125 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YHR020WYHR020W 2067 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 PPM2YOL141W 2088 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 SES1YDR023W 1389 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 ARP10YDR106W 855 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 SNM1YDR478W 597 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 FMP48YGR052W 1110 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 IPI1YHR085W 1005 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 ATG36YJL185C 882 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 CUE4YML101C 354 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 HMT1YBR034C 1047 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 YPK2YMR104C 2034 nt4.97□□□□□ -1.61
VHS2P40463 KTR5YNL029C 1569 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS2P40463 LDB7YBL006C 543 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS2P40463 SPS18YNL204C 903 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS2P40463 BIO3YNR058W 1443 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS2P40463 ACS1YAL054C 2142 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS2P40463 SIS2YKR072C 1689 nt4.96□□□□□ -1.62
VHS2P40463 UBP7YIL156W 3216 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS2P40463 CBP1YJL209W 1965 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS2P40463 YTA12YMR089C 2478 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS2P40463 RHO3YIL118W 696 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS2P40463 HOC1YJR075W 1191 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS2P40463 GTO3YMR251W 1101 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS2P40463 YBR113WYBR113W 483 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS2P40463 CRZ1YNL027W 2037 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS2P40463 MEC3YLR288C 1425 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS2P40463 MPH3YJR160C 1809 nt4.95□□□□□ -1.62
VHS2P40463 MET3YJR010W 1536 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS2P40463 PLB3YOL011W 2061 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS2P40463 MIA40YKL195W 1212 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS2P40463 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS2P40463 TOS6YNL300W 309 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS2P40463 CAR1YPL111W 1002 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS2P40463 YPL113CYPL113C 1191 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS2P40463 YBR124WYBR124W 360 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS2P40463 DOT1YDR440W 1749 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS2P40463 GSH2YOL049W 1476 nt4.94□□□□□ -1.62
VHS2P40463 PYC1YGL062W 3537 nt4.93□□□□□ -1.62
VHS2P40463 MAD3YJL013C 1548 nt4.93□□□□□ -1.62
VHS2P40463 YOL036WYOL036W 2286 nt4.93□□□□□ -1.62
VHS2P40463 FLC3YGL139W 2409 nt4.93□□□□□ -1.62
VHS2P40463 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt4.93□□□□□ -1.62
VHS2P40463 SUF16tG(GCC)C 71 nt4.93□□□□□ -1.62
VHS2P40463 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt4.93□□□□□ -1.62
VHS2P40463 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.5 ms