Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Col18a1P39061 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Col18a1P39061 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col18a1P39061 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms