Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1aP36536 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sar1aP36536 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sar1aP36536 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms