Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lef1P27782 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lef1P27782 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lef1P27782 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lef1P27782 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms