Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata3P23772 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata3P23772 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata3P23772 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata3P23772 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata3P23772 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata3P23772 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms