Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tap1P21958 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tap1P21958 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tap1P21958 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tap1P21958 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tap1P21958 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tap1P21958 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tap1P21958 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tap1P21958 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms