Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ntf3P20181 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ntf3P20181 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms