Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ms4a1P19437 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ms4a1P19437 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms