Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RargP18911 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RargP18911 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RargP18911 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RargP18911 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RargP18911 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RargP18911 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RargP18911 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RargP18911 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RargP18911 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RargP18911 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RargP18911 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RargP18911 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RargP18911 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RargP18911 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RargP18911 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RargP18911 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RargP18911 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RargP18911 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RargP18911 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RargP18911 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RargP18911 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RargP18911 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RargP18911 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RargP18911 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RargP18911 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RargP18911 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RargP18911 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RargP18911 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RargP18911 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RargP18911 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RargP18911 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RargP18911 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RargP18911 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RargP18911 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RargP18911 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RargP18911 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RargP18911 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RargP18911 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RargP18911 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RargP18911 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RargP18911 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RargP18911 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RargP18911 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RargP18911 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RargP18911 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RargP18911 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RargP18911 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RargP18911 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RargP18911 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RargP18911 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RargP18911 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RargP18911 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RargP18911 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RargP18911 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RargP18911 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RargP18911 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RargP18911 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RargP18911 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RargP18911 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RargP18911 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RargP18911 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RargP18911 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RargP18911 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RargP18911 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RargP18911 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RargP18911 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RargP18911 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RargP18911 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RargP18911 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RargP18911 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RargP18911 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RargP18911 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RargP18911 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RargP18911 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RargP18911 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RargP18911 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RargP18911 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RargP18911 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RargP18911 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RargP18911 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RargP18911 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RargP18911 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RargP18911 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RargP18911 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RargP18911 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RargP18911 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RargP18911 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RargP18911 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RargP18911 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RargP18911 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RargP18911 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RargP18911 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RargP18911 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RargP18911 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RargP18911 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RargP18911 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RargP18911 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RargP18911 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RargP18911 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms